Борьба народа Гондураса особенно активизировалась под влиянием революции в России. Для подавления народных выступлений американские империалисты направляли в Гондурас свои войска (1917, 1919, 1924, 1925). В 1927 году возникли первые коммунистические группы, созданы первые профсоюзы (сельскохозяйственных рабочих).

Кризис 1929—33 гг. резко ухудшил положение народных масс, что вызвало ряд новых восстаний (1931, начало 1932). При поддержке американского капитала в Гондурасе была установлена террористическая диктатура Т. Кариаса Андино (был президентом в 1933—49 гг., с перерывами), который запретил все демократические организации и предоставил ЮФКО новые концессии (1935 г.). В 1942 году США оккупировали принадлежавшие Гондурасу острова Суон и построили там военные сооружения (аэродром, радиостанцию и др.). Во 2-й мировой войне Гондурас участия не принимал, хотя и объявил в декабре 1941 войну Германии и Италии. Разгром фашизма способствовал подъёму забастовочного движения в Гондурасе, развёртыванию массовых антиправительственных и антиимпериалистических выступлений (особенно мощные из них в 1944 и 1947). В 1949 году Кариас Андино под давлением массового движения ушёл в отставку; к власти пришёл ставленник США, бывший военный министр Х. М. Гальвес (1949—54 гг.), при котором США осуществили в 1954 году с территории Гондураса вооружённое вторжение в Гватемалу. Народное движение всё больше активизировалось.

В апреле 1954 года состоялась нелегальная конференция гондурасских марксистов, объявившая о создании компартии. В мае 1954 года произошла всеобщая забастовка рабочих банановых плантаций, в результате которой ЮФКО пришлось пойти на удовлетворение требований рабочих. На президентских выборах 1954 года победил либерал Р. Вильеда Моралес, однако под нажимом США результаты выборов были признаны недействительными и временным президентом стал вице-президент Х. Лосано Диас. В стране не прекращались волнения. Диктатура Диаса просуществовала 2 года. В октябре 1956 года армейские круги осуществили государственный переворот, и в течение года у власти находилась военная хунта. На выборах в декабре 1957 года вновь победил Вильеда Моралес.

Рост возмущения против засилья американцев заставил правительство Моралеса (1957—1963 гг.) на первых порах принять некоторые меры по развитию экономики: национализация одной железной дороги, введение Кодекса законов о труде, подготовка закона об аграрной реформе (встретившая сопротивление крайне правой оппозиции, опиравшейся на ЮФКО). Однако уже в 1960 году был принят декрет, запрещающий демократические издания, в 1961 году разорваны дипломатические отношения с революционным правительством Кубы, в 1962 году на совещании министров иностранных дел стран — членов Организации американских государств (ОАГ) Г. потребовал исключить Кубу из ОАГ. В октябре 1963 года правительство Моралеса было свергнуто в результате военного переворота, возглавленного командующим вооружёнными силами полковником О. Лопесом Арельяно. Переворот был совершен под предлогом "борьбы с проникновением коммунизма" в страну. Военная хунта во главе с Арельяно встала на путь преследования не только прогрессивных политических партий, но и патриотически настроенных представителей национальной буржуазии.

В феврале 1965 года военная хунта провела выборы в Национальную конституционную ассамблею. Победу одержали консерваторы. В марте 1965 года ассамблея провозгласила Лопеса Арельяно "конституционным" президентом. Против правительства Лопеса Арельяно активно действовал ряд организаций. В ноябре — декабре по всей стране прошла волна забастовок. Лопес Арельяно, продолжая проводить репрессии в отношении демократических организаций, запретил деятельность политических партий (за исключением правящей и Либеральной), поставил под жёсткий контроль большинство газет.

В 1960-е годы произошло заметное ухудшение отношений между Гондурасом и Сальвадором; причиной этого явились пограничные споры, а также многочисленные факты переселения безземельных и безработных граждан Сальвадора в Гондурас. 14 июля 1969, вслед за скандальным футбольным матчем между командами этих стран, состоявшимся в Сан-Сальвадоре и сопровождавшимся стычками между болельщиками, вспыхнула т. н. "футбольная война". Четыре дня военных действий, согласно оценкам, стоили жизни двум тысячам человек. В июне 1970 конфликт удалось частично урегулировать — страны договорились об установлении демилитаризованной зоны, а в 1976 согласились уладить спор через посредников. Отношения между Гондурасом и Сальвадором оставались напряженными вплоть до 1980, когда был подписан мирный договор. В 1992 пограничные споры были решены Международным судом (ООН).