Главой первого правительства стал Ф.Томбалбай, избранный в сентябре 1960 председателем ППЧ. Принятая 28 ноября 1960 конституция закрепила в стране многопартийность; в области экономики был взят курс на развитие предпринимательства и привлечение иностранных инвестиций. Правительство пользовалось поддержкой бывшей метрополии.

В 1962 на севере страны начались массовые волнения мусульман, недовольных политикой правительства. Выразителем их интересов стала подпольная военно-политическая организация «Фронт национального освобождения Чада» (ФРОЛИНА), созданная в 1965. Антиправительственные выступления мусульман были подавлены при помощи французских войск в 1969. Новую волну протеста вызвала кампания насильственной африканизации населения страны (замена христианских имен на африканские, введение ритуального обряда инициации и пр.), начатая правительством в 1973. В апреле 1975 в результате военного переворота президент Ф.Томбалбай был убит, а власть перешла к генералу Феликсу Маллуму. Его попытки достичь национального примирения, в том числе создать коалиционное правительство с участием лидера ФРОЛИНА Хиссена Хабре, не увенчались успехом. В ноябре 1979 сформировано переходное правительство во главе с руководителем вооруженных сил ФРОЛИНА Гукуни Уэддеем.

В марте 1980 начались вооруженные столкновения сил Х.Хабре и Г.Уэддея. Острота и длительный характер гражданской войны усугублялся не только этническими и религиозными противоречиями, но и активным вмешательством во внутренние дела со стороны Франции и Ливии (войска последней были введены в страну по просьбе правительства Г.Уэддея). Экономическое положение в Чаде ухудшилось также в результате сильных засух 1970–1980-х. Благодаря вмешательству ОАЕ, 16 ноября 1981 ливийские войска покинули Чад. Тем не менее, столкновения между войсками правительства и мятежниками не прекратились. В 1982 Х.Хабре занял г.Нджамена (название столицы с 1973), а Г.Уэддей на севере страны создал собственное правительство.

1 декабря 1990 власть захватил выходец из народности загава генерал Идрисс Деби (лидер «Патриотического фронта спасения», сформированного в марте того же года в Судане). В апреле 1991 на базе этой организации создана партия «Патриотическое движение спасения» (ПДС). 4 декабря 1990 И.Деби провозглашен президентом. Вооруженное противостояние длилось до 1993, когда в результате национальной конференции (январь-апрель) была принята хартия, регламентировавшая политическое развитие Чада в течение переходного периода. Согласно этому документу, до проведения многопартийных выборов главой государства и верховным главнокомандующим оставался И.Деби. Многопартийная система введена в апреле 1993.

В 1994 из-за ухудшения внутриполитической обстановки в стране переходный период был продлен еще на год. В январе 1996 в Габоне между представителями власти и оппозиции Чада была подписана декларация о принципах внутреннего урегулирования. После проведения референдума, в котором участвовали 3,5 млн. граждан Чада, 31 марта 1996 принята новая конституция.

Президентские выборы 1996 состоялись на многопартийной основе и прошли в два тура. Президентом избран И.Деби, набравший 69% голосов избирателей. Выборы в Национальное собрание (ноябрь 1996) принесли победу ПДС. В экономической политике правительство сделало ставку на дальнейшее освоение нефтяных месторождений, начатое в кон. 1970-х. Добыча нефти на месторождении Доба (юг страны) началась в 1993. Его освоение велось международным консорциумом, в состав которого вошли американские компании «Экссон-Мобил» (40% акций) и «Шеврон» (25% акций), а также малазийская компания «Петронас». К нач. 1998 были приватизированы 34 государственные предприятия (программа приватизации принята в 1992). С целью контроля над управлением доходами от продажи нефти парламент Чада в 1999 принял закон о создании специальной коллегии в составе 9-ти членов. На экономику Чада благотворно повлияла 50%-ая девальвация франка КФА в 1994 – темпы экономического роста в 1997 превысили 4,1%.