Подавление деятельности оппозиции продолжалось; инакомыслящие обвинялись в том, что они работают в интересах США. В апреле-мае 2004 в ходе трех новых процессов суду были преданы 16 человек. Это вновь вызвало резкую реакцию со стороны ЕС. В то же время, в течение 2004 власти освободили по состоянию здоровья более 20 человек из числа осужденных и арестованных в 2003 и в предыдущие годы. В мае-июле 2005 ок. 150-ти диссидентов проводили собрания и митинги с требованиями реформ, освобождения заключенных и обсуждения возможностей мирного перехода к Кубе «после Кастро».

В июле-августе свыше 50 человек были арестованы (в т.ч., по обвинению в нарушении закона о защите национальной независимости). Тем не менее, ситуация на Кубе в целом продолжает оставаться стабильной, поскольку в социальном и материальном плане население страны живет более благополучно, чем граждане других латиноамериканских государств. В 2005 ВВП составил 39,17 млрд. долл. США, а его рост – 8%. Инфляция – 4,2%, рост безработицы – 1,9%. По данным Программы развития ООН в 2005, на Кубе на 100 тысяч жителей приходился 591 врач (в США – 549, в Боливии – 73). Согласно отчету ЮНЕСКО за 2001, кубинские учащиеся опережают сверстников в других странах Латинской Америке по успеваемости в области математики и языкознании.

В июле 2006 после перенесенной операции на кишечнике Фидель Кастро временно оставил все высшие государственные посты и передал бразды правления страной своему брату Раулю Кастро. 3 декабря 2007 он был выдвинут кандидатом на одно из 614 мест в национальном парламенте, которое он должен был занять, чтобы быть председателем Госсовета. В феврале 2008 Фидель Кастро заявил о своем отказе от поста председателя Госсовета Кубы по состоянию здоровья.

Парламент Кубы избрал председателем Государственного Совета Кубы (фактически главой государства) Рауля Кастро 24 февраля 2008.